Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms