Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms