Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms