Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC192P0DO97 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms