Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms