Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms