Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NGFRP08138 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms