Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSMBP08118 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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