Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHBP07195 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHBP07195 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHBP07195 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHBP07195 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHBP07195 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHBP07195 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDHBP07195 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDHBP07195 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDHBP07195 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDHBP07195 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDHBP07195 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHBP07195 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHBP07195 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHBP07195 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHBP07195 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHBP07195 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms