Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYBBP04839 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYBBP04839 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYBBP04839 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CYBBP04839 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYBBP04839 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms