Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EGFRP00533 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGFRP00533 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms