Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKL5O76039 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL5O76039 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms