Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLOT1O75955 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms