Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3JO75822 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms