Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN15O75808 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms