Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD5O60279 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD5O60279 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms