Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms