Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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