Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATCO43716 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATCO43716 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATCO43716 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATCO43716 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms