Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP8B1O43520 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms