Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HTRA2O43464 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms