Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTSS1O43312 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms