Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLOCKO15516 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms