Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP290O15078 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP290O15078 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP290O15078 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP290O15078 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP290O15078 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP290O15078 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP290O15078 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP290O15078 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP290O15078 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP290O15078 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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