Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASKO14936 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASKO14936 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASKO14936 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASKO14936 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASKO14936 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASKO14936 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms