Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIP1O00291 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIP1O00291 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIP1O00291 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIP1O00291 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms