Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms