Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39AO00148 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39AO00148 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms