Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms