Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L13C9JLJ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L13C9JLJ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms