Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms