Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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