Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCP1A6NGW2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms