Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF316A6NFI3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF316A6NFI3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms