Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms