Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms