Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms