Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms