Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms