Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms