Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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