Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PTPRMP28827 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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