Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PDGFDQ9GZP0 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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