Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms