Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MTAPP2-201ENST00000437063 832 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC239367.1-201ENST00000439389 936 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FABP5P7-201ENST00000524732 405 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ARMC8-215ENST00000471453 2910 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SLITRK3-202ENST00000475390 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TGFB2-201ENST00000366929 5053 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 ATP5HP4-201ENST00000414313 475 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC244034.1-201ENST00000428027 792 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LYZL4-202ENST00000441172 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RN7SL761P-201ENST00000463259 278 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01438-201ENST00000512794 556 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNA5SP459-201ENST00000516628 100 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC00547-201ENST00000612438 3314 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TCF4-224ENST00000564403 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DEPDC5-206ENST00000400249 5458 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GJB2-201ENST00000382844 2309 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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