Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ITGB3BPQ13352 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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ITGB3BPQ13352 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ITGB3BPQ13352 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ITGB3BPQ13352 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGB3BPQ13352 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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