Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SP140Q13342 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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