Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms