Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CASQ1P31415 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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