Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 KCNS3-202ENST00000403915 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TRIM35Q9UPQ4 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TRIM35Q9UPQ4 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TRIM35Q9UPQ4 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TRIM35Q9UPQ4 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TRIM35Q9UPQ4 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRIM35Q9UPQ4 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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